大極殿の北西350ｍの地点である。

東西69.4ｍ、南北77.0ｍの方形区画を築地で囲み、内部に礎石建物を「コ」字形に配置する典型的な省クラスの政庁である。

官衙区画の北寄り中央に正殿、東寄りに脇殿１棟、南西隅に掘立柱建物１棟がある。政庁の西側に厨房（台所）と考えられる建物群がある。建物配置からみて、西側にも脇殿があると推定される。正殿は、東西棟の二面庇付礎石建物である。梁間２間（6.0ｍ）、桁行５間（15ｍ）である。脇殿は、東脇殿のみ確認している。少なくとも梁間２間（6.0ｍ）、桁行５間（15ｍ）ある。正門は未確認であるが、建物配置からみて南に設けられたと推定される。長岡宮で初めて政庁が確定した事例である。

政庁正殿と東脇殿（東から）